1. Conselho Permanente
| 2005/2008 | 2008/2011 | 2011/2014 [1] | 2014/2017 | |
| Presidente | D. Jorge Ortiga | D. Jorge Ortiga | D. José Policarpo | D. Manuel Clemente |
| Vice-Presidente | D. António Montes Moreira | D. António Marto | D. Manuel Clemente | D. António Marto |
| Secretário | D. Carlos Azevedo | P. Manuel Morujão | P. Manuel Morujão | P. Manuel Barbosa |
| Vogais | D. José Policarpo D. Albino Cleto D. José Francisco Alves D. António Marto |
D. José Policarpo D. Albino Cleto D. José Francisco Alves D. Gilberto dos Reis D. Manuel Clemente |
D. Jorge Ortiga D. Gilberto dos Reis D. António Marto D. António Francisco D. Manuel Quintas |
D. Jorge Ortiga D. António Francisco D. José Francisco Alves D. Anacleto de Oliveira D. Virgílio Antunes |
2. Comissões Episcopais [2]
2.1. Nos anos 2005 a 2014
| 2005/2008 | 2008/2011 | 2011/2014 | |
| Educação Cristã | D. Tomaz Nunes | D. Tomaz Nunes | D. António Francisco |
| Pastoral Social | D. José Francisco Alves | D. Carlos Azevedo | D. Jorge Ortiga |
| Laicado e Família | D. António Carrilho | D. António Carrilho | D. Antonino Dias |
| Vocações e Ministérios | D. António Francisco | D. António Francisco | D. Virgílio Antunes |
| Cultura, Bens Culturais e Comunicação Social | D. Manuel Clemente | D. Manuel Clemente | D. Pio Gonçalo de Sousa |
| Liturgia | D. António Taipa | D. Anacleto de Oliveira | D. Anacleto de Oliveira |
| Mobilidade Humana | D. António Vitalino | D. António Vitalino | D. António Couto |
| Missões | D. Manuel Quintas | D. António Couto | D. Manuel Quintas |
| Doutrina da Fé e Ecumenismo |
D. António Marto | D. Manuel da Rocha Felício | D. Ilídio Pinto Leandro |
2.2. Nos anos 2014 a 2017
| 2014/2017 | |
| Educação Cristã e Doutrina da Fé | D. Manuel Pelino |
| Pastoral Social e Mobilidade Humana | D. Jorge Ortiga |
| Laicado e Família | D. Antonino Dias |
| Vocações e Ministérios | D. Virgílio Antunes |
| Cultura, Bens Culturais e Comunicações Sociais | D. Pio Gonçalo de Sousa |
| Liturgia e Espiritualidade | D. José Cordeiro |
| Missão e Nova Evangelização | D. Manuel Linda |
3. Delegados da Conferência Episcopal Portuguesa
| 2005/2008 | 2008/2011 | 2011/2014 | 2014/2017 | |
| Relações Bispos/Vida Consagrada | D. Gilberto dos Reis | D. António Montes Moreira | D. Manuel Quintas | D. Manuel Quintas |
| Conselho Superior da UCP [3] | D. Jorge Ortiga | D. Jorge Ortiga | D. José Policarpo | D. Manuel Clemente |
| CCEE [4] | D. Jorge Ortiga | D. Jorge Ortiga | D. José Policarpo | D. Manuel Clemente |
| COMECE [5] | D. Amândio Tomás | D. Amândio Tomás | D. António Marto | D. António Marto |
| Pontifício Colégio Português [6] | D. Jorge Ortiga | D. Jorge Ortiga | D. José Policarpo | D. Manuel Clemente |
[1] Em junho de 2013 foram eleitos Presidente: D. Manuel Clemente, Vice-Presidente: D. António Marto e Vogal: D. António Couto.
[2] Indica-se apenas o nome do Presidente da Comissão Episcopal.
[3] UCP – Universidade Católica Portuguesa.
[4] CEE – Conselho das Conferências Episcopais Europeias.
[5] COMECE – Comissão dos Episcopados da União Europeia.
[6] Pontifício Colégio Português – sito em Roma.